Таможенное дело относится исключительно к ведению федеральных органов государственной власти и осуществляется непосредственно таможенными органами, которые относятся к разряду правоохранительных органов. Согласно п. 1 ст. 401 ТК таможенные органы составляют единую федеральную централизованную систему, в которую входят (п. 1 ст. 402 ТК):
- федеральная служба, уполномоченная в области таможенного дела,
- региональные таможенные управления,
- таможни,
- таможенные посты.
В систему таможенных органов также входят не являющиеся правоохранительными органами учреждения, которые находятся в ведении ФТС России для обеспечения деятельности таможенных органов (п. 4 ст. 402 ТК).
Под таможенным органом понимается федеральный государственный орган исполнительной власти, наделенный специальной компетенцией в области таможенного дела и выполняющий возложенные на него функции по развитию внешней торговли.
Центральным аппаратом системы таможенных органов является Федеральная таможенная служба Российской Федерации (ФТС России). В соответствии с Положением о Федеральной таможенной службе, утвержденным постановлением Правительства РФ от 26 июля 2006 г. № 459 «О Федеральной таможенной службе», ФТС России является уполномоченным федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим в соответствии с законодательством РФ функции по выработке государственной политики и нормативному правовому регулированию, контролю и надзору в области таможенного дела, а также функции агента валютного контроля и специальные функции по борьбе с контрабандой, иными преступлениями и административными правонарушениями.
С целью реализации полномочий в сфере таможенного дела ФТС России имеет право:
- создавать, реорганизовывать и ликвидировать таможенные посты, специализированные таможенные органы, компетенция которых ограничивается отдельными правомочиями для выполнения некоторых функций, возложенных на таможенные органы, либо совершения таможенных операций в отношении определенных видов товаров,
- определять регион деятельности таможенных органов,
- утверждать общие или индивидуальные положения о таможенных органах.
Нижестоящими по отношению к ФТС России органами являются региональные таможенные управления, а также таможни центрального подчинения (Внуковская, Шереметьевская, Домодедовская таможни, Центральная акцизная таможня, Центральная энергетическая таможня, Центральная базовая таможня, Центральная таможня – кинологический центр ФТС России).
По видам решаемых задач все региональные таможенные управления могут быть разделены на несколько групп:
- территориальные или общие региональные таможенные управления,
- специализированные региональные таможенные управления.
Территориальные региональные таможенные управления созданы в соответствии с границами федеральных округов. Специализированные региональные таможенные управления призваны способствовать нормальной работе всей системы таможенных органов по отдельным направлениям выполняемых ими функций (правоохранительной, контрольной и др.). Специализированными региональными таможенными управлениями являются:
- Региональное таможенное управление радиоэлектронной безопасности объектов таможенной инфраструктуры,
- Региональное оперативно-поисковое управление,
- Центральное экспертно-криминалистическое таможенное управление,
- Региональное таможенное управление организации силового обеспечения.
Функции непосредственного таможенного контроля, производства таможенного оформления, предотвращения контрабанды, а также функции сбора и анализа статистической информации выполняют таможни и таможенные посты. С точки зрения местонахождения таможни подразделяются на пограничные и внутренние: пограничные таможни проверяют наличие и правильность заполнения документов, предъявляемых в таможенных целях, внутренние таможни проводят таможенный и личный досмотр, проверяют документы, ревизуют финансово-хозяйственную деятельность предприятий – субъектов ВЭД. Собственно процедурами таможенного контроля и таможенного оформления товара, как правило, занимаются таможенные посты. Другими словами, таможенные посты наделены полномочиями по приему и проверке грузовых таможенных деклараций.
Региональные таможенные управления, таможни и таможенные посты действуют на основании общих или индивидуальных положений, утверждаемых ФТС России по согласованию с федеральным министерством, уполномоченным в области таможенного дела. Таможенные посты могут не обладать статусом юридического лица (п. 3 ст. 402 ТК РФ).
Осуществляя таможенное дело, таможенные органы одновременно являются органами государственного таможенного контроля, а также обладают полномочиями по осуществлению валютного контроля операций, связанных с перемещением товаров и транспортных средств через таможенную границу РФ. Решая правоохранительные вопросы, таможенные органы обладают статусом органов дознания, субъектов оперативно-розыскной деятельности, а также имеют право осуществлять производство по делам об административных правонарушениях.